作者：胖胖的小橘
接著就把剛才的事簡單說了一遍。
齊渝他們課題組遇到了麻煩，張麗芳教授最近身體不太舒服，數學建模那邊推不下去，就聯絡了劉若傳老師幫忙推薦個人，劉若傳就推薦了顧銘。
“所以我就搞不懂了。”顧銘越說越來氣。
“他們叫我來幫忙，我給了建議，不聽就不聽吧，還當面說我是錯的。”
那邊的程偉其實冷靜下來以後也覺得自己剛才不太對。
畢竟人家確實是來幫忙的，就算意見不一樣，也不至於當面懟人家。
只是他實在受不了顧銘那個勁兒。
一個學數學的，全程一副“你們化學就是低人一等”的嘴臉。
所以他也沒說話。
顧銘說完以後，就看向李東。
“學弟，你給評評理。”
這下所有人都看向了李東。
李東笑著點了點頭。
然後心裡瘋狂的MMP。
我評理？我怎麼評理？
你剛才說的那些東西，數學部分我全聽明白了。
確定性ODE擬合隨機過程、馬爾可夫SDE的構建邏輯，這些我都懂。
但化學那邊的呢？
什麼構象態躍遷，什麼底物濃度反饋效應……
我連名詞都沒搞全，評個屁啊。
但畢竟他是青龍學習小組的群主。
裝高人這一塊，他自認為裝得毫無破綻。
所以李東很自然地笑了笑，目光不經意地掃向了齊渝。
也不說話。
齊渝接到他的目光，面無表情。
但心裡已經在瘋狂吐槽了。
你是不是沒聽懂？
化學那部分你是不是完全沒聽懂？
他知道這個國小弟接觸化學其實沒多久，而且之前問的問題，和這個課題的方向也不一樣。
估計是連名詞都沒搞明白吧。
齊渝在心裡嘆了口氣。
所以她用盡可能簡潔的語言，把化學這邊的核心概念給李東捋了一遍。
酶的構象動力學是什麼意思，就是酶分子不是一個剛性的球，它會在多個構象之間來回跳。
每個構象的催化效率不一樣，而且跳來跳去不是完全隨機的，前一個構象會影響下一個構象出現的機率。
這就是程偉說的“非馬爾可夫”有記憶。
還有底物濃度的反饋，底物不是一個被動的背景引數，它會反過來改變酶的構象分佈。
“簡單來說就是，這個體系是動態的、有記憶的、會被環境反過來影響的。”
齊渝說完，看了李東一眼。
李東還是那副波瀾不驚的表情。
但實際上他腦子裡已經炸了。
0.4的基礎屬性全部拉滿。
齊渝嘴裡說的“構象躍遷有記憶”，在他腦子裡自動翻譯成了帶記憶核的積分微分方程。
“底物濃度反饋”，翻譯成了外場引數耦合進狀態轉移機率。
齊渝說完了。
李東在心裡花了幾秒鐘把所有東西串了一遍。
他不可能完全理解這個課題的全部。
化學體系的實驗細節他確實不懂，這麼短的時間也不可能百分之百吃透。
能理解個八九成，已經很不錯了。
但他們吵的那個點，他算是徹底明白了。
然後就有點無語。
不是……
你倆吵得這麼激烈，原來是雞同鴨講啊？
顧銘說“確定性ODE擬合隨機過程不靠譜”，對的，這是他的數學直覺。
謝曉亮院士二十多年前就用單分子熒光實驗證實了這一點。
他抓住的是這個體系的數學本質。
程偉說“你那個馬爾可夫模型忽略了記憶效應和底物反饋”也是也對。
實驗上觀測到的東西就擺在那裡，不是你一句“數學直覺”就能抹殺的。
問題出在哪？
顧銘在說“你原來的工具選錯了，得換”。
程偉在說“你換的這個新工具也不對，因為它不符合我們的化學體系”。
一個在攻擊舊框架。
一個在否定新模型。
兩個人說的根本不是同一件事。
李東看向顧銘。
“顧銘學長。”
“嗯。”
“你剛才說用確定性ODE去擬合本質隨機的酶催化過程不可靠，這個判斷我沒什麼意見。”
李東頓了一下。
“說實話，在場的化學組做了這麼久的課題，都沒發現ODE框架本身有問題，你一來就看出來了。”
“能這麼快從一個化學體系的實驗資料裡，直接定位到底層數學框架的選擇錯誤，這種洞察力不是隨便什麼人都有的。”
這話不是拍馬屁。
因為它是事實。
顧銘愣了一下。
他當然被很多人誇過，但是很少有人能誇的這麼……嗯，客觀的。
而且還是被一個這麼牛逼的大佬誇。
顧銘有一瞬間，甚至覺得自己被低估了。
要不……我也去投一下《數學年刊》？
就在他飄飄然的時候，李東問了一個問題。
“不過學長，我能問你個事嗎？”
“你說。”
“你建的那個SDE模型，用的是標準馬爾可夫假設吧？”
顧銘點頭。
“嗯，那你覺得……”
李東的語氣很隨意，就像在聊天一樣。
“如果一個體系裡面，構象的弛豫時間比催化週轉的時間長了不止一個量級……這種情況下，無記憶假設還成立嗎？”
顧銘的表情變了。
馬爾可夫過程的核心就是無記憶性。
但如果弛豫時間遠大於週轉時間……
那構象躍遷的歷史路徑就會對當前狀態產生不可忽略的影響。
換句話說……系統天然就不是馬爾可夫的。
那他用馬爾可夫假設去描述一個非馬爾可夫的系統……
數學上當然是自洽的。
但它描述的，已經不是眼前這個化學體系了。
顧銘一下子愣住了。
他也是天才。
在李東說完這句話的瞬間，他就全明白了。
程偉之前那些話……什麼非馬爾可夫躍遷，什麼底物反饋效應，指的就是這個。
只不過程偉沒辦法用嚴格的數學語言把這件事講清楚。
所以聽起來就像是在用“化學直覺”否定“數學嚴謹”。
而他當時還在心裡嘲笑，你連非馬爾可夫過程的數學定義都說不出來，憑什麼否定我的模型？
現在回頭一看。
人家說的是對的。
只是翻譯出了問題。
而且他不知道為什麼，感覺自己的腦子突然比平時還清醒了幾分。
顧銘也不管其他人了。
他轉身走到白板前，一把拿起馬克筆。
他把之前那個標準馬爾可夫SDE的框架直接劃掉了。
然後在旁邊重新起筆。
構象躍遷不再用常數轉移機率矩陣，而是改用半馬爾可夫過程。
躍遷間隔的等待時間不再是指數分佈，而是一般分佈，天然就帶記憶效應。
底物濃度不再是固定的背景引數，而是作為外場變數，顯式地耦合進了轉移機率的表示式裡。
他寫了將近二十分鐘。
白板上密密麻麻全是公式。
寫完以後，顧銘放下筆，仔細看著白板好像是在驗證一樣。
“哦……原來是這樣。”
然後他轉過身，看向程偉。
“你過來看一下。”
“構象躍遷用半馬爾可夫過程建模，底物濃度作為外場耦合進轉移機率。”
“如果按這個框架重新算的話，你們的實驗資料應該能對得上。”
程偉走上前。
上一篇：我家艺人太没上进心了
下一篇：挨打永久加防御，神魔都打不动我